Ako ti treba debuger imaš ga u ZS. Za "kompajliranje" u opcode možeš da koristiš Zend Guard ili neki drugi opcode cache mehanizam (IonCUBE, ne znam da li APC podržava čuvanje opcode u fajl i naknadno čitanje istog). Sve to po vrlo skromnoj ceni - $250 za ZS i ~$900 godišnje za Zend Guard.
Što se JS tiče Firebug je i više nego dovoljan, a to da ti browseri prave problem znači samo jedno: treba još malo da čitaš
Uzmi PPK on JavaScript da popuniš osnove i staviš JS u konktest, malo više radi sa istim i sve će doći na svoje mesto.
Samo kratko - to što tebi neka platforma pravi "probleme" ne treba da znači da je sama platforma problematična.