Mi koristimo activeCollab (tickets modul) za praćenje bugova, feature requestova i stvari na kojima radimo, ali je on dostupan samo u skupljoj verziji (košta $399).
Možda ne bi bilo loše da pogledaš
FogBugz (on demand ili da ga instaliraš na svoj server) ili
Unfuddle (samo on demand). Nisu besplatni, ali znaš kako ide: koliko para toliko muzike.
Edit: preporučujem activeCollab zato što ga stvarno koristimo za to. Da ne mislim da je dorastao zadatku ne bih "a" rekao
