Do sada ovde nije pomenut sistemski nivo rešenja koja se odnose na interna linkovanja u sklopu sajta - kako odvojiti logiku poboljšanja navigacije korisnika (npr. uvođenjem novih vrsta navigacije), u odnosu na SEO efekte istog.
U sklopu
WP SEO All-in-One plugin-a postoji objašnjenje korišćenja delova strukture sajta koje je moguće postaviti u no-robots, ili u dodati a href atribut no follow. U helpu ovog plugin-a postoji objašnjenje da se može slobodno izabrati sistem strukture Web sajta koji se može ostaviti za index pretraživačima.
Sistemski, treba razdvojiti postavljanje problema linkovanja istog sadržaja na sajtu zbog pretraživača, i samog sistema poboljšanja navigacije korisnika kroz sajt (dodavanjem npr. tagova, dodatnih widgeta, rezultata pretraživanja i sl.). To znači da se na nivou definisanih "paralelenih" struktura sajta treba odlučiti šta jeste vidljivo pretraživačima, a šta se postavlja da nije vidljivo, i tada nema potrebe brisati alternativne navigacije zbog smanjenja broja internih linkova na stranici.
Problem nastaje onda kada se ovakvi alternativni sistemi navigacije kreiraju samo zbog SEO komponente, i naravno da tada nastaju problemi.
Sasvim je druga priča kada se sistem "paralelenih" struktura sajta postavi kako treba - šta će sve od toga pretraživači (Google) uzeti "u razmatranje", a šta ne.