Rails je u pitanju. Tamo ne postoji "root" folder. URL-ovi se mapiraju na aplikaciju preko "route"-ova.
Pitanje je da li bi ti uopšte radio PHP tamo. Probaj da staviš svoj PHP fajl u "public" poddirektorijum, u nekom smislu on odgovara rootu.
Ili, jbg, plati nekog ko zna Rails
ili ubedi klijenta da migrira Rails rešenje na platformu koju poznaješ.