WinSCP taj problem rešava prilično jednostavno: ne smara! Kad pošalješ zahtev ako je konekcija mrtva on se ponovo konektuje bez cimanja korisnika.
Što se TCa tiče isto je jako dobar ali par tikova (spoemnuto cimanje korisnika, umiranje konekcije i nemogućnost ubijanja iste (konstantan "PORT command failed" kad želite jednostavno da se diskonektujete) itd), ali radi posao. A i navika je čudo
PS: WinSCP mi se čini kao najpopeglaniji program tog tipa.
PPS: Jedan od odvarnijih, a popularnih programa sa kojima sam imao nesreću da radim je glupa Filezilla.